Nadawanie uprawnień dla użytkownika, który zamierza tylko zaimportować pewne pakiety SSIS, a później nimi zarządzać można ograniczyć do utworzenia loginu na serwerze SQL dla tego użytkownika, utworzenia mu usera w bazie danych msdb oraz przypisaniu go do roli bazy danych db_dtsltduser
Wykaz tych ról oraz wynikające z nich uprawnienia są dokładniej opisane tutaj (dla różnych wersji SQL):
http://technet.microsoft.com/en-us/library/ms141053(v=sql.90).aspx